1636年4月3日，因为广州、澳门、香港三地防御严密，荷兰舰队司令普特曼斯决定将总数43艘的大舰队分成两个部分。
将战斗力较弱的，船体老旧的船只留在香港和澳门中间的大澳岛，封锁珠江的出海口，断绝广州、澳门的对外贸易。
而剩下的船只则沿着海岸线北上，依次袭击中国沿海有价值的目标。普特曼斯选择的第一个目标，就是位于闽粤交界处，台湾海峡的西南口，处于韩江口外的南澳岛。
南澳岛距离大陆约12-13海里，东距台湾大员港近150海里，北距厦门约100海里，西南距香港180多海里。自宋以来，南澳就是东南沿海一带通商的必经泊点和中转站，岛上还设有一个大明总兵府。
不过和大明其他沿海卫所一样，南澳岛上的大明官兵也早就失去了作为军队的作用，他们平日里的工作不是下海打鱼，就是按照长官的命令维护下港口的治安而已。大明的军事改制，尚未波及到南澳岛上。
因此即便南澳总兵已经收到了荷兰人袭击广州珠江口的消息，这位总兵大人也只是戒备了半个月，便又再度放开了港口，准许部下下海进行渔业活动了。毕竟在这位总兵看来，港口每关闭一日，就意味着许多金钱在流失。
于是普特曼斯的舰队很快就在南澳岛海域抓住了出海打渔的南澳官兵，从他们口中了解了岛上的虚实。听说了这位总兵大人的行径后，普特曼斯便亲自带着三艘海船悬挂着葡萄牙人的旗帜闯入了南澳岛上的港口，趁着港口守军不备夺取了港口的两座炮台，并炮击了港口内的卫所。
南澳总兵不得不带着一部分居民和官兵逃入了南面的金山之中，据岛上的山寺自守。而大多数南澳港的居民和商人则选择了向荷兰人投降，这座港口的物资让荷兰舰队得到了补充，也让普特曼斯对接下来的作战有了更多的信心。
接下来普特曼斯又令四艘快艇进攻西面的沙汕，这四艘快艇沿着韩江进入了内陆数十里，沿途劫掠了十多个村寨，方才掉头返回了南澳岛。
普特曼斯在南澳修整了三日后，决定继续带着舰队北上，不过他将南澳岛当做了舰队在中国沿海的后勤基地，于是在此地留下了三艘快艇和300士兵以保卫南澳岛。
在两次分兵之后，普特曼斯的北上舰队便只剩下了31艘船只，其中用于远航的夹板船9艘，快艇12艘，平底船7艘，中国式戎克船3艘，总吨位达到了一万三千余吨。
四月十七日，普特曼斯率领的荷兰舰队抵达了厦门湾。当荷兰人的庞大舰队出现在厦门外海时，驻守厦门岛的副将施福顿时有些傻眼，虽然他已经知道了荷兰舰队北上的消息，但是他没想到荷兰人的舰队居然会这么庞大。
厦门港内的此时拥有的不过是30多艘中式战船和5、60艘放火船，剩下的便是没有战斗力的商船。而他的上司郑芝龙正带着台海巡检司的主力舰队防御着北港和大员港，根本不知道何时才能返回。
施福不得不收缩了防线，将金门诸岛的守军撤回了厦门岛及鼓浪屿。并派人前去质问荷兰人来厦门的用意，试图拖延一些时间。
普特曼斯将计就计，告诉使者他们是来向大明官府抗议，明军袭击热兰遮城夺取大员港一事而来，如果福建的大官不听取他们的抗议，那么他们就要向厦门施以同等的报复。
经过了三日的谈判，施福勉强同意普特曼斯可以带着不超过五艘的快艇进入厦门港和他见面交谈。施福思考着，如果只有五艘快艇进入厦门港，那么占据优势的反而他自己了，因此他认为荷兰人应当不会挑衅自己的部下，从而再拖上一两日。
但施福还是估错了普特曼斯的胆量，四月二十一日清晨，普特曼斯率5艘快艇驶入厦门港道，一直进入到了厦门舰队中间才抛锚停泊。荷兰人的诡异行动顿时引起了施福的注意，他正要下令自己的部下驾驶船只远离荷兰人的船只时，便看到对方的船上打开了炮门，向着四周的明军船只展开了炮击。
在这猝不及防之下，警惕性不高的明军船只顿时遭受了重创，停泊下来的荷兰快艇，火炮射击的精度和速度极快，在他们周边停泊的明军船只很快就失去了战斗力。不少明军将士不得不跳海逃生。而在四周的明军船只开始下沉之后，荷兰人才升起了红色战旗，正式向明军宣战。
荷兰人的这场突袭，不仅摧毁了一半的厦门舰队，还击沉了五、六艘商船。直到明军不再顾及自己的船只，使用港口的炮台对战场中心的荷兰船只进行射击后，普特曼斯方才下令拔锚撤离。
在这场突袭战中，荷兰人只有两艘快艇被明军的炮台击成重伤，但是却几乎摧毁了厦门岛可以出击的大型战船。
战后的施福极为悔恨，他知道自己是上了荷兰人的一个恶当，失去了这么多船只，厦门也就失去了出击的力量，现在只能谨守厦门港，等待北方联合舰队的来援，或是郑芝龙舰队从台湾的返回了。
普特曼斯虽然之后又发起了几次对厦门岛的进攻，但是施福利用鼓浪屿和港口的陆上炮台及小型放火船封锁航道的战术下，荷兰人再也没能取得什么有效的战果了。
这时普特曼斯从俘获的明人俘虏中得知，北面的福州驻扎着大明的浙闽总督，地位和皇帝身边的重臣相似后，便决定北上攻打福州，迫使这位总督大人向皇帝求援，以完成此次出兵的目的。