石仲棠带着黄蓉，一口气跑了十多里路，专找偏僻崎岖的山路，一方面可以避人耳目，另一反面山路多溪涧，可供他们涉水而行，令金兵难以跟踪追捕。
到得傍晚时分，终于在一处背风坡发现了一个山洞，才算是停当下来，虽然自己救得及时，但不知为何，黄蓉的状态极差，虽然没受什么伤，但却显得昏昏欲睡，后半段路程，几乎是被他背着过来的。
看黄蓉元气不足，石仲棠试探着为她输入了点“先天童子真气”，但却并没有多大作用，只能让她自己先休息一会儿，他则是出了洞外守着。
一方面是为了放风，免得金兵突然而至，无法及时作出反应；另一方面也是为了黄蓉的名声着想，虽然黄蓉这小东邪不会在乎，但他也不想落人口实，最重要的是黄蓉那我见犹怜的模样，让他心中戚戚，害怕忍不住会侵犯她，现在守在外面，眼不见，心不烦，倒是很快静下了心。
虽然是初秋时节，但在这深山之中，昼夜温差极大，更何况他还将自己外套给黄蓉盖上了，这样一来就更加受不了了。
就通过打坐用功，默默记诵“先天功”与“童子功”，依法照练，练了约莫半个时辰，只觉四肢百骸充塞劲力，浑身从内而外都有一股热气，全身暖和融融，说不出的舒服，即使是在这秋风之中，也不会寒冷。
正自欢喜，突然想起自进入“先天童子功”第四层，打开上丹田之后就一直未曾仔细研究过，趁着今夜无事，不妨探究一下也好。
在人体中，两眼中心为“祖窍”，也就是常说的上丹田，乃是任督二脉汇聚的最重要的关口，只要“祖窍”一通，任督二脉便会周游不息，也是打通任督二脉最重要的一环。但因为“祖窍”内通脑细胞，是人的真性，此处若受伤，轻则脑力受损，变成白痴；重则走火入魔，身死道消，所以一般人很难完全打通任督二脉。
任脉以人体正下方双腿间“会阴.穴”为起点，从身体正面沿着正中央上到唇下“承浆穴”；而督脉则是由“会阴.穴”向后沿着脊椎往上走，到达头顶再向下穿过两眼之间的“祖窍”，到达口腔上颚的“龈交穴”。
其中任脉主血，督脉主气，因此一般人正面受伤，就会血流不止，容易造成失血过多，而背脊受伤一般不会出那么多的血，但危害却更大，一般受伤之后很难恢复，这就是因为督脉主气，气乃万物之源，背后受伤就是伤了本源。
而这也就是习武之人常说的血气的由来。
一般情况下，因为人脑结构太过复杂，一般的功法根本不敢延伸到脑中，但“童子功”却是反其道而行，非但将脑中的经脉打通，更是将“祖窍”当做了储存真气的场所，从这一胆大的行径来看，就可以发现“童子功”的逆天之处，不愧是达摩祖师亲笔所书的神功。
与“祖窍”相对的就是“生死窍”，也就是常说的下丹田，也可称之为“气海”，一般的武者，这里就是储气的唯一场所。
与“童子功”那么多经脉、气穴不同，“先天功”主要修炼的就是下丹田，也就是“生死窍”。在“先天功”中，这“生死窍”又被称为“先天穴”，其内有”金炉“起着练精化气的作用，气动则成“生死窍”，否则只是一般的穴罢了。
若“祖窍”是天，“生死窍”就是地，上管性、气、神，下管命、血、精，所谓“天下地上安‘祖窍’，日西月东聚先天”，说的就是它们唇齿相依的情况，性命必须双修，若舵和桨、矛和盾的关系，缺一不可，如此方能“精气神”合一。
而在下、上丹田之间的中丹田，就是俗称的黄庭，在人体中起着中转的作用，但在“童子功”中，却是把这里也当做了储气的场所之一，如此一来，石仲棠比一般人就多了两个储气的场所，再加上“先天功”拓宽经脉的异能，他体内的真气，比起东邪、西毒、南帝、北丐加起来的多。
石仲棠有心试试自己三个丹田到底可以储存多少真气，索性就不断运转“童子功”吸取天地的能量，注入上、中丹田之中，以“先天功”练精化气注入下丹田。
在这里要说明的是，“童子功”是以吸取外部能量为主，而“先天功”则是以自身的精气为主，虽然天地间的能量很多，聚气自然也就快，但却比不上自身精气精纯，好在“童子功”有淬炼真气的功效，在经脉中运转之时，会将吸入的杂气释放出，如此一个主外，一个主内，但又汇聚于一身，正符合了天人合一的状态。
足足过了数个时辰，中丹田与下丹田都以注满，但上丹田却好像是无底洞一般，不管石仲棠注入多少真气，都不见充盈，倒是让他越发好奇这小小的一个“祖窍”，到底有多大的空间，这或许就是佛家常说的“戒子纳须弥”吧！
正当石仲棠和眉心的无底洞斗气之时，突然听得洞内的黄蓉叫道：“靖哥哥，你冤枉蓉儿了，那不是我做的！”
石仲棠微微一怔，猜想到黄蓉可能是做梦了，当下也没有进去叫醒她，谁知道过不多时，又听她说道：“靖哥哥，我错了，大不了我向杨过道歉，你别不理蓉儿啊！”
听到这里，他哪还不明白，想必是黄蓉暗使手段害杨过，却被郭靖发现了，可是照理说以他们二人的感情，也不可能因为一个小小的杨过出现裂缝。原著中，二人唯一一次闹矛盾，也只是在郭靖误会黄药师杀了江