目前主要涉案叛逆都已被抓。孔融等十七位大臣供认不讳，罪证确凿。经过朝廷诸府联合商议，奏请天子和长公主下旨，即刻予以诛杀。
御史台上奏弹劾蔡邕、刘和、吕布等七位大臣，认为他们对天子遇刺有不可担卸的责任，有失察、包庇、纵容、泄漏国政机密等诸多罪责，应该立即罢职，羁押于廷尉府审讯。
长公主急于稳定局势，当即下旨，接受朝廷奏议，七日后，诛杀孔融等十七位叛逆，九族皆灭。
罢免丞相蔡邕、御史大夫刘和等六位大臣，即刻羁押于廷尉府。
辛评、荀谌、审荣等人无罪释放，官复原职，并给予一定的赏赐以示安慰。
所有襄阳特使全部关进廷尉府，严加审讯，务必彻查藏匿在朝中的叛逆，以免天子和朝中大臣再遇不测。
长公主认为卫尉吕布忠诚可靠，驳回弹劾。
对官制修改一事，拒绝做出回应。
左卫将军、执金吾赵云回避。由右将军杨凤暂时代领执金吾，督领北军。
八月十二，长安。
朝中大臣们有些着急了，代丞相周忠、太尉荀攸、光禄勋张燕等大臣要求廷尉府立即罗列罪名，诛杀吕布。太傅杨彪、大司马徐荣、廷尉卿鲜于辅和大司农李玮坚决反对。
要动吕布，首先就要调整军中将领，张辽现在不领兵了，但魏续、宋宪、李封等人都是统军大将，先不把这些人解决了，吕布就不能动，否则极有可能引发叛乱，局势将一发不可收拾。另外，吕布的夫人小月是老大臣张喜的侄女，张喜家是关洛大族，和关西杨家、关中马家、河东卫家都是姻亲，杀吕布影响太大。
大臣们争执不下，这时司马防出了个主意。南军四营主将除了张隼是卢植的弟子外，其它郭勋、杨意、刘遇都是张燕的人。让张燕利用私人关系密告郭勋、杨意等人，让他们在城内先闹起来。吕布无力弹压，治军不严，威胁到皇宫安全，长公主想保他也保不住了。
八月十三，太尉荀攸、代御史大夫司马防、光禄勋张燕、大司农李玮急赴栎阳，再度和长公主商量官制修改一事，并上奏弹劾吕布，要求即刻调换南军统帅。
长公主断然拒绝。
吕布和天子谋刺案有牵连，遭到大臣连番弹劾的事迅速传遍了南军各营，将士们当即闹了起来。
吕布如果参予了谋刺天子，他的手下肯定要受到牵连，首当其冲的就是南军各营大将，到时脑袋搬家了都无处诉冤。郭勋、杨意、刘遇、张隼联名上奏，要求吕布主动请辞，免得害死了无辜兄弟。长公主好言安慰，但此刻军心已乱，城内形势极度紧张。
吕布迫不得已，上奏请辞卫尉一职，但要求以左卫将军的身份，继续留在长公主身边保护她的安全。
长公主毫不犹豫地答应了。她现在处境非常危险，朝中大臣正在步步进逼，虎贲、羽林又不值得信任，南军将士已经乱了，而何风的军队滞留在城外根本进不来，她唯一能相信的人就是吕布了。
长公主急召光禄勋张燕、右中郎将田豫，命令他们从皇宫内撤出虎贲羽林，皇宫的戍卫之责交给吕布、何风，否则她下旨急调庞德、卫峻的铁骑进京护驾。
张燕、田豫拒绝接旨。这圣旨一接，自己地脑袋也就岌岌可危了。
虎贲羽林竞然置长公主的安危于不顾，弃守皇宫，将来就是死罪啊。自己宁愿背上抗旨的罪名，也不能让虎贲羽林离开皇宫半步。
司马防急忙出面调停。何风的军队还是不要进城，这有违律法，尤其是在现今这个敏感时期，更不能进城。虎贲羽林也不能离开皇宫，这也违背律法，张燕和田豫两位大人根本承担不起这样的罪责。至于吕布大人，殿下可以留在身边。在这个特殊时期，吕布大人和他的亲卫悍卒可以留在宫内，但只能戍守殿下的金华殿，其它地方不许去。
长公主气得恨不得拔剑杀人。何风的军队不给进，吕布的军队只能守在金华殿，那自己岂不同于自囚于金华殿？
长公主忍气吞声，答应了。
八月十五，太傅杨彪、大司马徐荣、太常郭策等朝中十几位大臣联袂赶到栎阳，劝谏长公主修改官制。
长公主要求天子返驾，然后再谈修改官制的事。
八月十六，小天子接到了长公主的书信。此刻他正在右将军杨凤、中垒将军于毒等人的指导下，演练攻防战术，“战场”上一万多将士正在他的指挥下奋勇“作战”。小天子“战”兴正浓，根本不想回去，他眉头一皱，写了封回书，姑姑，朕这几天上吐下泻，发热不止，行走不便，过几天再说。为了让自己的谎话逼真一点，他故意把字写得歪歪扭扭的，但他觉得还不够逼真，又在绢布上滴了很多水珠，充做眼泪，表示自己很痛苦。
赵松看他鬼鬼祟祟的，很不放心，陛下，你刚才写了什么？给臣看看？小天子哈哈一笑，没什么，没什么，秀儿说她要来，她一来，朕岂不惨了？所以，朕写了回书，说朕生病了，叫她过几天再来。
八月十六晚上，这份书信送到了长公主手上。
长公主大吃一惊，勃然大怒，把太傅、大司马等公卿大臣们一顿臭骂，“你们好大的胆子，竟敢拿陛下威胁我？立即把他接回栎阳，否则我杀了你们。”
大臣们吓坏了，急忙书告杨凤，立即把天子送回来。
八月十九日上午，杨凤督请天子返驾。小