这些被称为“凋零”的黑色物质遍布地球大气层，明明没有核战争，这些东西却像是核冬天的尘埃般，遮蔽了整个天空。同时，它们之中饱含恶意的那部分，会无差别地对周围的生命发起攻击，无数平民因此丧命，何闻笛的父母，也是在救助亲友时去世的。
人类虽然也通过对“超能力·和弦”的开发而获取了更先进的技术，在这些纯靠“数量”致胜的天灾面前，却仍然只能苟延残喘。
何闻笛的姐姐和姐夫，正是这些“超能力者”中格外优秀的两人。他们在这个混乱的时代站了出来，无论是战斗还是学术研究上，都做出了自己的贡献！也因此被选为大灾难时代后的第一批宇航员，前往缥缈的远方去探索“天灾”的真相。
至于任务目标，“白琴”嘛？她是这个时代最强大的超能力者，世界上第一个“s级”。跟何闻笛的姐姐和姐夫也是好友。因为“人造太阳”不能缺少她的力量，她并没有随着宇航团队出征，而是留守在地球上，并因为力量过于庞大而遭到排斥，在“大洋国”的某处离群索居。
想要找到她，就必须借助吴今所属的，“黑域信使”的力量。
不过，这个时候的何闻笛，却也无心再考虑什么任务了……
她缓缓低吟着父亲喜欢的“怀旧空吟闻笛赋”，时而又是母亲爱讲的“谁家玉笛暗飞声”，魂不守舍地骑着摩托车，好几次差点摔倒。
在进入天朝领土的时候，她才终于从这种茫然中回过神来，像是想起了什么似的，拉扯了吴今的衣角。
“阿今，能带我去姥姥姥爷的墓前看看吗？还有跟你爸爸、妈妈一起住过的家？”
“能是能，不过……”男孩在犹豫。
“放心，我不会做什么傻事的……早就跟你妈妈发过誓了。”何闻笛低声道，“要去，是因为觉得，你那傻妈妈也不会违背她的誓言。”
“誓言？”
“嗯，我们姐俩稍微有点小秘密，甚至，在我死掉之后也……”说着，何闻笛想起了自己那皎月暗海的心界中，莫名出现的姐姐的身影，以及两人告别时她说过的话。
她说，她要用自己的方式去帮助何闻笛，要帮何闻笛看透“血脉”的秘密。
就算跨越生死，跨越了整整二十一年，何闻笛也相信，那个“承诺”，姐姐绝不会忘记。
她一定会设法传达到的，血脉的情报也好，被无情的时间磨灭的……家人的心意也好。
——只因为，两个人合在一起，才是“天才美少女侦探·何闻笛”。
“带我去吧，谢了。”何闻笛静静说道。