至于火药库爆炸的具体原因，一时间众说纷纭，有人说是地震引起的，因为北京城西南有地震断裂带，王恭厂爆炸的时候气候干燥，加上地震，引起了静电作用，引起的火花，造成火药库爆炸，那么多的火药同时爆炸威力可想而知，火药库的人员死伤惨重，尸体被炸碎所以头颅肢体从天上掉下。
至于附近人衣服都没了，那是爆炸冲击波和引起的大火造成的！衣服首饰飘到西山，也多有夸张，即使真有，那也不奇怪，爆炸加上大火，肯定造成不少人的衣服被扯烂，又由于北京地区风大，当时是五月，顺着东南风被刮到西山不是没可能！
相对于地震引起的爆炸这个观点，还有的人说是上天排下了神灵前来惩罚大明王朝。而这神灵的具体表现则是一些看起来很是神奇的现象。
天启爆炸时，北京城“从城的东北方至城西南传来一阵轰隆声，出现了一个特大的火球在空中滚动”。也是接着就发生了爆炸，“忽有声如吼，从东北方渐至京城西南角，灰气涌起，屋宇动荡。须臾，大震一声，天崩地塌，昏黑如夜”。有大而黑的蘑菇、灵芝状云柱直竖于城西南角。
天外来物在近地点爆炸，造成极其强大的冲击波，在爆炸的零点及周围，冲击波自上而下几乎是垂直而来，且冲击力极大，足以将树的枝、皮或人的衣服“剥去”。在这种强大的冲击波之下，火是无法燃烧的，无论多大的火都被瞬间吹灭，因此虽然爆炸当然伴随着火，但爆炸的中心“不焚寸木”。随之四散而开的冲击波就几乎是横向的了，自中心不规则地向外辐射，而且像原子弹爆炸之后产生的冲击波一样，以极高速度水平扩散，冲击力也是极大的，摧枯拉朽，波及甚广。
大爆炸前！
“宗主，毁天灭地孔明灯已经制作好了，并且已经安装在神火飞鸦上面了，时刻能够发射！”北京城王恭厂附近一处阴暗的地方，二三十个身穿黑袍的男子聚在了一起。
“好。很好！发射神火飞鸦，目标，王恭厂！”
一架硕大的神火飞鸦上面，盘踞着一个几丈宽的孔明灯，神火飞鸦携带着这只孔明灯飞上了天空，在天空当中，神火飞鸦脱离，巨大的孔明灯开始缓缓地向下落去。
“看，那是什么东西！”京城的居民很快就发现了天空当中飘落的孔明灯。
京城的天空十分明亮，突然间，从城的东北方至城西南传来一阵轰隆声，出现了一个特大的火球在空中滚动。天空中有丝状、潮状的五色乱云在四处横飞，有大而黑的蘑菇、灵芝状云柱直竖于城西南角。
当这巨大的孔明灯光球降落到离地面千来米的时候，接着就发生了惊天动地的大爆炸，方圆二十多里之内，瞬间夷为平地。
这场大爆炸突如其来，其惨烈、诡秘世所罕见，发生的原因至今仍然从说纷纭，谁也解释不清。爆炸当时本来天空晴朗，忽然就听到一声巨大的轰雷响起。“隆隆”地在大地上滚过，声音震撼天地。
从京城的西南角涌起一片遮天盖地的黑云。不大一会儿，又是一声巨响，天崩地裂。顿时，天空变得一片漆黑，伸手不见五指。东至顺成门大街，北至刑部街，长三四里，方圆十三里，万余间房屋建筑顿时变成一片瓦砾。两万多居民非死即伤，断臂者、折足者、破头者无数，尸骸遍地，秽气熏天，一片狼籍，惨不忍睹，连牛马鸡犬都难逃一死。王恭厂一带，地裂十三丈，火光腾空。东自通州，北至密云、昌平，到处雷声震耳，被损坏的房屋建筑无数。
“末日天灾，注定大明不能长久了！”看着眼前的一切，黑袍老者满意地笑了笑。