王继恩的平叛大军终于占领成都了，但是大蜀的农民起义军仍在继续战斗，就在成都城门的十里之外，就有农民军的阵地。叧外，在成都以西、以东和以南的川蜀地区，仍有几十万义军在里战斗。
当初太宗皇帝任命雷有终为峡路东路转使，沿长江逆流而上调发军粮，雷有率军行进到三峡时，遇到一小股义军，雷有终是便和这股义军生了战斗，雷有终率领他的运粮队边走边打。当他行进到广安时，又遇到义军的大队人马，这是宋军的弟兄们都顿时都紧张起来，可是雷有终却神淸气爽，谈笑自若，指挥若定，这时义军人马两股合－股，把雷有终他们包围其中，押粮队有些人就想缴械投降，可是雷有终仍淡定自如，大股的义军就要冲上来了，眼看着雷有终他们就要大难临头了，可是突然从后面突然杀出－股宋军，雷有终和这股宋军里应外合，宋军顿时腹背受敌，纷纷落水，原来这股宋军奇兵是雷有终事先安排好的！
就在王继恩攻克剑州的时候，马知节是先锋官，王继恩看马知节不归附自己，于是公报私仇，派他去守彭州而配给他300老弱不堪的宋军，并且把以前守彭州的宋军全部调走。没过多久，有10万义军前来攻打彭州，义军随即便把彭州包围起来，然后从四面对彭州展开全面进攻，你想那么大的－个彭州，只有300来人来把守，300对10万这简直是天方夜谭！马知节奋力抵抗，无奈兵太少了，战斗进行到了黄昏，马知节只有退守州衙份了，但是马知节却长叹－声：“死在乱臣贼子的手中，不是好汉！”于是他把手中的大刀－横，拼死杀出一条血路，向城外突围去了！马知节突出重之后，便拼命向外奔跑，然后在一个小树林里休整，到了第二天黎明时分，援军来到了，马知节于是便和援军－起又重新杀入彭州城，经过拼杀，彭州城又重新回到宋军手中。太宗皇帝知道马知节的事迹后，大为感动：“贼兵人多，咱们的马知节兵少，真的不容易啊！”随即任命马知节为益州钤辖！
再说宋军集全力攻下成都后，王继恩以重兵留驻，又由攻势转成了守势。张余见宋朝孤军无援，坐守成都，乘势聚集农民军各部，得数万人。张余没有去硬攻成都，而是向宋朝守卫空虚的南部和东川各州进取。张余军一举攻下嘉州，进兵东南，攻下戎州、泸州，沿江而上，连续攻下渝州、涪州、忠州、万州，张余的用意很明显，他就是向东攻打，突破夔州（今湖北三峡），然后向荆湖地区发展，离开川蜀这闭塞之地，如果让张余突破了夔州，没有了川蜀这闭塞的地形，那农民军就会向龙入大海一般无人能挡！那大宋王朝可就吃不完兜着走了！
张余要想突破夔州，必须先突破开州（四川开县），张雍－面向朝廷请兵，一面派派秦传序紧急奔赴开州，朝廷接到战报之后，立即命令马步军副指挥使白继斌为峡路巡检使，率兵开赴夔州。
秦传序马不停蹄日夜兼程终于赶到开州，等到秦传序来到开州，义军已把开州团团围住，正在展开激烈地进攻！义军连破几州，开州士兵也人心不稳，秦传序来到开州后，身先士卒，与士兵们同吃同住，士兵们的心一下子稳定下来了！
大战在即，秦传序对他进行了战前动员：“将士们！我们即将用我们的热血去捍卫我们的家园，我们要用我们的热血去捍卫和平，去捍卫太祖皇帝开创的太平盛世，如果在让这场川蜀叛乱持续下去，我们的子孙就会再次走上颠沛流离之路，我们的父母妻子将再次深受乱世之苦，这是一次分裂国家的叛乱，我们坚决要与他们作战到底！”
守城的士兵深受感动，他们纷纷表示誓与开州共存亡！
秦传序倾其所有购买了大量酒肉然后拿来全部牿赏士卒。义军开始总攻了，张余下达了死命令，－定要拿下开州。义军越来越多，他们如潮水般蜂拥而至，而开州城里只有不到五千人马，并且他们伤亡惨重，秦传序面对潮水般的义军，他知道开州城守不住了，许多士兵在城破前劝秦传序赶快化装逃跑，但秦传序不为所动，只是掏出笔来写了几个字：“臣尽死力战，誓不降贼！”
开州城终于被张余攻破了，秦传序在城破之时举火自焚！
秦传序的家就在荆湘之地，他的儿子叫秦奭，他得知父亲从身殉国，便逆流而上，奔赴开州寻找父亲的尸体。但是当秦奭的船行进到虁州时，却因滩高水急，船翻了，秦奭也落水身亡。人们都感叹：“秦氏父子，父死与忠，子死与孝，真是可敬可叹啊！”此事很快就传到朝廷，皇帝知道此事后，大为感动，他立即下诏任命秦传序的次子秦煦为殿直，并且赏赐秦家10万钱！