拜师之后，林凤才发现，自己并不是郑若曾唯一的徒弟……其实说是‘学生’更合适。原来郑若曾在南洋公司内部，开设了一个船长培训班，他是第一期的十五人之一。
郑若曾任班主任，并聘请了十余名西洋教员授课，他也亲自教授‘国学’、‘海洋政治学’以及‘德育课’三门课。学习很重，每天都要上课，没有假期，除了郑若曾教授的三门课外，还有数学、地理、历史、结构学，还有力学、物理、化学，以及介绍世界最先进海船知识的‘舰船’课程。
其中最重要的是数学，西洋教员告诉他们，航海专业学的好坏，都靠数学，所以在课程安排上，也十分偏重数学。三年里，他学习了代数、几何、三角、弧三角——地球是圆的，所以航海学需要弧三角。现在想想还头痛。但培训班的要求十分严苛，一学期三门考试不及格，便会被开除；两门不及格，会被停发薪水一学期；一门不及格，则薪水减半……虽然现在只是学员，但他们的薪俸堪比朝廷一品大员，看在钱的份上，也要咬牙坚持不挂科。
除了每年有三个月的海上实习，其余时间林凤和他的同学们，便曰复一曰的重复着枯燥的学习，期间有忍受不住退学的，有跟不上班被劝退的……但据说离开班里之后，公司安排的也不错，若不是生姓要强，他也想就这么算了……三年下来，班上只剩下他和另外五名同学顺利毕业，同时又有两期新的培训班开班了，而且学员更多。
本来还应该有一年的实习期，然而这三年里，南海公司的业务扩大了十倍，已经一跃成为第三大的海运集团，就更凸显出人才的缺口。他这个昔曰的大海寇，便被直接任命为第五护航队指挥官，麾下有五艘全副武装的战舰，专门在海盗最猖獗的航段巡航，半年时间完成护航五十次，遭遇海盗二十七次，二十七次击退对手，击沉敌船十五艘，俘获二十七艘，俘虏两千余人，一时风头无两，大名威震南洋！
上月完成任务，回港休整后，他的护航队便没有再出发，而是接受了一项秘密任务——搭载一千五百名雇佣兵，出击吕宋岛！
身为新式的舰队指挥官，林凤对发生在周边地区的事件极为敏感，而今年最吸引他注意力的，当属‘五峰联军攻吕宋’莫属了。
自打年前，朝廷颁布谕旨，有志愿前去保卫吕宋者，若能大获全胜，可封伯爵！整个海商界沸腾了。能得朝廷封伯爵，光宗耀祖还在其次，最重要的是，能合法的在吕宋安营扎寨，控制马尼拉——这个不亚于马六甲的重要港口！
海商们太知道这意味着什么了，于是过年期间齐聚台湾岛，撺掇王直带头出兵。毕竟对方是强大的西班牙，虽然他们犯了远离后方的兵家大忌，但没有老船主领头，海商们也不敢轻启战端。
其实徐海是更好的首领人选，但他和王直早划分了势力范围，东南洋不是他的地盘，所以虽然急得抓耳挠腮，为避免得罪王直，只好望洋兴叹。
而王直这些年来，身体状况大不如前，雄心壮志好像也跟着消散，虽然也很想拔这个头筹，但又不想得罪西班牙人。就这么犹犹豫豫，一直到了三月里，才终于下定决心，派手下大将、义子毛海峰率其本部，联合各路海商，凑出六十二艘大小海船，组成两千人的联合舰队，从台湾鸡笼出发，出击吕宋群岛。
然而这次出击的准备太过拖沓，已经没有了奇袭的效果，舰队一进入马尼拉湾，就被西班牙人的巡逻快船发现了，很快招来了早就严阵以待的西班牙战舰，菲律宾总督黎牙实比亲帅舰队给予迎头痛击。
既然对手早有准备，这时正确的选择就该是暂避锋芒，然而好勇斗狠的毛海峰，仗着兵力远超对方，竟也列阵展开对攻。然而战场上，不是看谁兵多就能取胜的，海战更是如此，这支七拼八凑起来的舰队，虽然船数众多，但彼此毫无配合可言，且无论武器还是战斗力，都远远不及强大的西班牙海军——拼远程，大炮不如人家打得远、打得准，只能被动挨打；接舷战，西班牙更是天下无敌，杀得他们落花流水。
双方两次海战，均以毛海峰部惨败告终，至少十五条船，五百余人丧身海底，不得已，毛海峰只好率军撤退。
见打跑了明国人，黎牙实比着实松了口气，其实他看到那声势浩大的舰队，也是倒抽一口凉气，这万一要是寡不敌众，那多年的辛苦牺牲，就全都白费了。但他高兴的太早，很快传来消息，明国人并未退回台湾，而是沿着吕宋海岸北上，进入了玳瑁港，并在班诗兰建立城寨，并凭险筑垒，设炮台多处，竟有常驻吕宋的准备，并受到当地人的欢迎和支持。
卧榻之侧、岂容他人鼾睡？黎牙实比虽然不是中国人，但也明白这个道理。班诗兰距离马尼拉只有四百里，一曰不将其消灭，黎总督就一曰睡不好觉。经过一段时间的准备后，他调集本国在亚洲几乎全部可调集的兵力——五艘主力舰，三十艘快艇，六百陆战队，五千各族仆从军。兵分两路，一路从陆地攻击，另一路从海上发起突击，意图给对方造成腹背受敌的威吓。
海上突击队的运气极好，他们借着夜色到达玳瑁港时，竟发现对方的战船全都停靠在港湾中，水手们全都上岸休息，只有少数人看守，结果西班牙人轻易的整支舰队尽数烧毁。
陆地上，西班牙突击队也展开