在陆军发动猛烈进攻的同时，德国海军主力也在芬兰湾以东发动了大规模的海上攻势，在清扫了大部分水雷之后，德国舰队在空军的支援下一举攻入俄国波罗的海舰队最后的要塞和军港——位于芬兰湾东端科特林岛上的喀琅施塔得，俄舰队连同旗舰“尼古拉一世”在内的大半舰只被击沉，其余全部向德军投降，沙俄的三大舰队至此只剩下在海参威芶延残喘的太平洋舰队。
在德国的鼓动下，俄国各地尤其是沙俄时代被迫纳入俄国版图的哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦等纷纷宣布建立革命政权并脱离沙俄统治，俄国远东区域也宣布建立军人政权，弗伊洛夫带领亲信士兵发动兵变只可惜不幸失败了。在这种情况下，以索科洛夫为首的沙俄军队不得不重新坐在谈判桌前，并全盘接受了德国提出的一系列要求。随后，索科洛夫在奥伦堡宣布成立非帝制的、暂时由军人进行管制民主政府，他本人则出任临时总统，并代表俄国与德国签署了《奥伦堡条约》，德俄战争宣告结束，但等待俄国却是以圣彼得堡为中心的革命政府和以奥伦堡为中心的民主政府对峙的局面，漫长的分裂和内战时期到来了。