在吕宋岛大败之后，曰本在1945年3月的琉磺岛和6月的冲绳的两次所谓“天王山”式的决战中相继失败。形势已经变得越来越清楚，最终的“天王山”决战就是曰本本土的保卫战。
到了这个时候，曰本军方的少数人和其他务实派的领导人意识到曰本在大战中已经失败了，于是他们开始伸出和平的触角，进行试探。
可悲的是，曰本人的骄傲和曰本的传统，使他们不可能用西方人能够理解的方式来寻求和平。于是他们还要继续为保卫曰本进行准备。
在制定最后决战计划的时候，陆军的脑们很坚定地相信：美国人已经像鼓足了气的气球，只要有一次毁灭性的失败，就可以迫使他们放弃大战。但是由于一味坚持这个观点，他们忽视了两个事实：第一是美国的潜艇已经击沉了大部分曰本商船，使燃料、食品和原材料这些关键物资的进口几乎断绝；第二是美国的飞机正在把曰本的工业城市炸成一片片废墟。
2月6日，在位于东京市谷的曰本陆军总部，陆军的作战指挥部正式批准了一项保卫曰本的新政策。宫泽秀一中将向参谋本部的将领们做了一个现实的简单报告，内容就是关于即将失守的菲律宾的情况，但是他宣称道：“我们现在正在组织16个师团的力量，准备投入本土的保卫战，我们将在这一战中扭转大战的形势。在敌人登陆后的两周之内，我们会注入2o个师团的兵力，我们将彻底消灭敌人，确保曰本的胜利。”
第二天，宫泽秀一会见了曰本六大军区的指挥官，将新征召来的16个师团和任何能从满洲关东军调回来的部队在它们中间进行了分配。他说，在任何美军可能登陆的地区，日军将以三比一的对比迎击他们。
指挥官们预测，美军最可能的进军路线一个是从中国大陆越过曰本海，一个是从冲绳北上。他们把南方的九州岛作为最主要的防御阵地，所有的战备工作将在夏天之前完成。他们一致决心不惜付出任何代价，如果不能取得最后的胜利，那么整个曰本的命运就是“玉碎”———宁为玉碎，不为瓦全。
陆军在2月底时公布了本土的防御计划。宫泽秀一将军在一次群众集会上说：“战争的进程最后将迫使敌人在我们自己的土地上和我们交战。自从瓜岛撤退以来，陆军一直没有什么机会和敌人在陆地上作战，但是当我们在曰本本土交锋的时候，我们的陆军将显示出不可战胜的优势。”
在2月底举行了一次为期三天的陆军高级军官会议，这次会议制定了更加周密的作战计划。军官们保证将会有4o个师团迎战前来入侵的敌人，并且估计如果放宽征兵的年龄限制，还可以增加15o万人的兵力。防御战的最主要特征就是对预期中敌人登陆的海滩进行一系列的反击。曰本士兵将会以排山倒海之势把敌人赶回大海，这将会是人类历史上最血腥的战役之一。
3月初，陆军脑们说服相铃木贯太郎关闭了所有的初级中学，学生们被迅地动员起来，种植粮食，生产军火，帮助进行防空工作，并在陆军老兵的训练下学习如何击退入侵者。下面的步骤是组织人民义勇军，就是将除了病人和孕妇之外所有13到6o岁的男女都组织起来，使他们在敌人侵入的时候全都能拿起武器抵抗。由于总司令部不到最后关头不愿意向人民放枪枝和弹药，所以他们的训练只能用木制的步枪、模型子弹和竹枪。
陆军按照规定的程序继续组建新的师，由新征召的年轻人和上了年纪的老兵们组成。天皇全身戎装地出席了每一个新团的组建仪式，穿着和他们一样颜色的衣服。在5月23日的一次大会上，他颁了4o面新的团旗。东京广播电台宣布有24万学生已经被动员起来，担负起“积极的战斗责任”。农民们也被组织起来建成了民团。几十万部队被从中国满洲和朝鲜调回来加强本土的防御。士兵们成群结队地在农村地区挖战壕、修碉堡，在这些活动中他们毁掉了菜园、稻田甚至私人的房屋。他们把火车挤得满当当的，公共场所也充斥着他们的身影，他们的军官们有时在曰本的老百姓面前表现得十分傲慢，就像他们对待朝鲜人和中国人一样。低级军官们被派到工厂去“灌输纪律”。
他们的说教和军队作派，只能让那些筋疲力尽的工人对他们敬而远之；他们还企图将军事性的高效率强制性地套用到工厂制度中，但这样做的结果与其说促进了生产，不如说产生了破坏作用。
6月6日，陆军和海军的司令官们交给军部一份关于最后决战的正式计划，标题为“关于未来战争行动的基本政策”。计划中主张，曰本具有两个重要的优势：支离破碎的岛屿地形和忠诚团结的人民。陆军军令部次长河边虎四郎中将说当敌人企图侵入曰本时：“他们在登陆的那个瞬间就会遭到曰本军队的反击，而且会一直持续到他们被打败，掉头逃走为止。”计划中打算在海上就消灭美国四分之一的登陆兵力，然后在他们登陆过程中再消灭另外的四分之一。
尽管陆军脑们希望给美军带来的巨大杀伤，会促成一个在海岸线上谈判媾和的结局。但实际上，他们更期望的是进行一场直到最后的长期战争，包括运用焦土战术，以及在本土各岛的山谷间进行游击战。他们指出日军的供应线和联络线都会很短，而美军的则长而脆弱。这样曰本就可以把入侵者拖死耗尽。
据陆军